劳动争议仲裁案件中的调解程序一般如下：(1)确定或者建议适当的调解方式、在调解程序中，仲裁员相互之间、仲裁员与当事人之间以及当事人双方之间可以协商适当的调解方式。调解可以通过书面或者面对面等方式进行。(2)分清是非曲直。仲裁员应当查清案件事实，分清责任，听取当事人的陈述和申辩。(3)提出建议方案。仲裁庭应当遵循客观、公平和公正的原则，提出解决争议的具体建议，供当事人参考或者接受。(4)制作调解书或者恢复仲裁。调解成功、达成协议的，仲裁庭应当制作调解书。调解不成功的，仲裁庭应当及时宣布调解终结，迅速恢复仲裁程序，防止久调不决。
《劳动争议调解仲裁法》规定，调解达成协议的，仲裁庭应当制作调解书。调解书是指仲裁庭制作的记载对当事人劳动争议进行调解的过程和结果的具有约束力的法律文书，是经双方当事人协商并经仲裁庭批准的协议。与裁决书一经作出就发生法律效力不同，调解书不是作成后马上生效，而是要由双方当事人签收后才生效。调解书应当载明仲裁请求和当事人协议的结果。调解书应当由仲裁员签名，并加盖劳动争议仲裁委员会的印章，送达双方当事人。调解书与裁决书虽然法律效力相同，但在何时生效上却不同，调解书并非作出后马上生效，而是要等到当事人签收后才生效，而且要求双方当事人签收，也就是说，既不是一方当事人签收就对该方生效，也不是一方签收就对双方生效，而是只要一方未签收就对双方都无效，只有双方都签收，才对双方都有效。
调解书的法律效力主要表现在：(1)使仲裁程序终结。调解书一经生效，仲裁程序即告结束，仲裁机构便不再对该案进行审理。这是调解书在程序上的法律后果。(2)纠纷当事人的权利义务关系被确定。这是调解书在实体上的法律后果。(3)任何机关或组织都要在重新处理该案方面受调解书约束。也就是说，对于仲裁机构出具了调解书的争议，任何机关或组织都不得再做处理。
既然调解书须经签收后生效，因此调解书一经签收，当事人不得反悔，但在签收之前应当允许当事人反悔。调解不成或调解书送达前一方当事人反悔的，仲裁庭应及时作出裁决。这是因为达成调解协议的过程就是仲裁庭的审理过程，制作调解书时实际上审理已经完毕。所以当事人拒绝签收调解书时，仲裁庭没有必要再经过仲裁程序重复已经完成的审理，而直接裁决即可。因当事人拒绝签收调解书而使调解无效时，仲裁庭可以直接裁决，以免久调不决，使当事人的权利义务关系长期处于不确定状态。
一般情况下，调解程序在下列情形下终止：(1)当事人达成调解协议，由仲裁庭制作调解书并送达双方当事人，经双方签署后，调解程序终止；(2)一方或双方当事人明确表示拒绝调解的，调解程序终止；(3)仲裁庭根据实际情况认为不宜调解，明确告知双方当事人。《劳动争议调解仲裁法》第一种情况下的终止，标志着案件审理完毕；后两种情况下，调解程序终止后，审理活动自动转人仲裁程序。
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