进行亲子鉴定后，必然会产生两种法律后果。一是经鉴定“父”与“子（女）”存在有血亲关系，那么，原存在的人身关系、亲属关系及财产关系等都没有发生任何的变化，也不会直接产生任何的法律后果。二是经鉴定“父”与“子（女）”确实不存在有血亲关系，那么从法律上讲，必然会产生较多的法律问题。
（一）身份关系的变化。原来是“父子（女）”关系，父亲与母亲都是该子女的法定监护人，对子女的生活、学习、安全等负有法定的义务。但现经鉴定后不存在这种血亲关系，在法律上也就不具有“父”子（女）的法律地位，也即其“父”从法律上来说没有这些义务。从法理上来说，这种情况具有“溯及力”，可以一直溯及到从该小孩出生时起，期间发生的继承、赠与等均不产生法律效力。但如在鉴定以前，女方曾告知男方有关该子女的情况，男方对此没有异议，并有足够的证据予以证实的，应视为男方与该子女间有收养关系，应从法律上确认他们的养父子（女）关系。该“父亲”还是应承担法律规定的义务，当然他也依法享有相应的权利。
（二）关于在离婚案件中过错情况的确定。在夫妻关系存续期间，女方与其他男性保持两性关系，并生育了他们的非婚生子女，且长期以来未将实情告知其丈夫，这是严重违反我国《婚姻法》第四条中“夫妻应当互相忠实，互相尊重”的规定，也有违我国社会公众普遍认同的社会公德，给男方也带来了比较严重的精神损害。因此，女方在婚姻纠纷中有较大的过错。依据《婚姻法》的有关规定，在处理共同财产时，除对无过错方应给予适当的照顾外，女方还应承担男方一定的精神损害赔偿金。
（三）关于该“子女”抚育费的承担问题。婚姻关系存续期间，男方在不知情的情况下，抚育该“子女”的抚育费，在夫妻离婚时，如男方未提出异议或请求，一般不主动予以考虑。但如男方在处理其离婚案件时，提出要求女方返还其以前的抚育费时，笔者认为对此应适当考虑，但在审判实践中一般不适宜直接判返还抚育费，而是在处理夫妻共同财产时可结合有关情况，一并予以考虑。笔者认为掌握的原则是：“标准从严、酌情承担”，一般掌握在女方应承担男方以前已支出的抚育费的10－30％，在本婚姻案件中一并处理，同时在法律文书中加强说理。
（四）离婚后对该小孩的抚育费问题。依据我国的有关法律法规，夫妻离婚后，因男方与该子女已没有血亲关系，因此，男方已没有义务再支付该小孩的抚育费。如女方无力抚养小孩，应由小孩的另一法定监护人即其亲生父亲承担相应的抚养费用。如在离婚后经鉴定方知小孩与他不具有血缘关系，离婚后已经支付的抚育费，男方可以全额或部分要求女方返还。
（五）关于已赠与给子女的财产的处理。如夫妻双方协议离婚，到民政局办理离婚手续时，将全部或部分夫妻共同财产赠与给“子（女）”所有的，笔者认为，对此情况，如男方有足够的证据（如亲子鉴定）证明没有父子间的血亲关系，那么男方有权可以通过一定的途径，要求确认该协议内容部分无效，返还原属于他的财产份额。因为这种财产赠与是附有条件的，与一般的赠与不同。此条件就是这孩子必须与他有血亲关系，而当时赠与时他也确信他们之间有血亲关系，现该条件已不存在，因此赠与人有权予以撤销。但依法应在知道或在知道的一年时间内提出。
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